Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms