Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms