Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MID2Q9UJV3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms