Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFDP1Q9UEE9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms