Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms