Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms