Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPASTQ9UBP0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPASTQ9UBP0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms