Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHL13Q9P2N7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms