Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms