Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ASCL3Q9NQ33 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms