Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIPCQ9C0C6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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