Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NIFKQ9BYG3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms