Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms