Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNN2Q99439 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNN2Q99439 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNN2Q99439 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms