Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC114Q96M63 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms