Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCOLN3Q8TDD5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms