Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms