Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC71Q8N4P6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LRRC71Q8N4P6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms