Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APTXQ7Z2E3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms