Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTF1AQ7RTS3 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms