Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACAD11Q709F0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACAD11Q709F0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms