Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPX1

TBC1D3C, TBC1 domain family member 3C, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3CQ6IPX1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TBC1D3CQ6IPX1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TBC1D3CQ6IPX1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms