Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FRMPD1Q5SYB0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms