Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms