Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MIR1587-201ENST00000583319 53 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC018695.2-201ENST00000602789 498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC022296.3-201ENST00000608823 403 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms