Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UVSSAQ2YD98 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms