Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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GEN1Q17RS7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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