Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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