Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP2B3Q16720 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP2B3Q16720 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms