Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CARTPTQ16568 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms