Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCOA1Q15788 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCOA1Q15788 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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