Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms