Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL9A3Q14050 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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