Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF5Q13568 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF5Q13568 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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