Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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