Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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