Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
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IFT88Q13099 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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IFT88Q13099 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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