Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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PTPN13Q12923 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
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PTPN13Q12923 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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PTPN13Q12923 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
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