Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GTF3C1Q12789 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GTF3C1Q12789 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms