Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RBBP4Q09028 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms