Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CXCL9Q07325 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CXCL9Q07325 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms