Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms