Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms