Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COG7P83436 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
COG7P83436 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
COG7P83436 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
COG7P83436 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COG7P83436 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG7P83436 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG7P83436 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms