Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
THOP1P52888 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
THOP1P52888 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
THOP1P52888 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
THOP1P52888 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THOP1P52888 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
THOP1P52888 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THOP1P52888 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
THOP1P52888 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
THOP1P52888 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THOP1P52888 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THOP1P52888 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
THOP1P52888 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THOP1P52888 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
THOP1P52888 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
THOP1P52888 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
THOP1P52888 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
THOP1P52888 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THOP1P52888 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
THOP1P52888 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
THOP1P52888 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
THOP1P52888 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
THOP1P52888 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
THOP1P52888 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
THOP1P52888 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
THOP1P52888 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
THOP1P52888 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
THOP1P52888 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
THOP1P52888 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
THOP1P52888 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
THOP1P52888 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
THOP1P52888 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
THOP1P52888 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
THOP1P52888 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
THOP1P52888 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
THOP1P52888 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
THOP1P52888 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
THOP1P52888 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms