Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms