Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NESP48681 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NESP48681 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NESP48681 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NESP48681 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NESP48681 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NESP48681 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NESP48681 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NESP48681 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NESP48681 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NESP48681 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NESP48681 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NESP48681 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NESP48681 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NESP48681 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NESP48681 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NESP48681 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NESP48681 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NESP48681 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NESP48681 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NESP48681 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NESP48681 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NESP48681 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NESP48681 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NESP48681 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NESP48681 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NESP48681 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NESP48681 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NESP48681 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NESP48681 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NESP48681 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NESP48681 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NESP48681 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NESP48681 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NESP48681 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NESP48681 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NESP48681 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NESP48681 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NESP48681 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NESP48681 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NESP48681 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NESP48681 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NESP48681 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NESP48681 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NESP48681 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NESP48681 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NESP48681 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NESP48681 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NESP48681 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NESP48681 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NESP48681 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NESP48681 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NESP48681 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NESP48681 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NESP48681 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NESP48681 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NESP48681 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NESP48681 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NESP48681 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NESP48681 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NESP48681 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NESP48681 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NESP48681 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NESP48681 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NESP48681 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NESP48681 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NESP48681 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NESP48681 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NESP48681 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NESP48681 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NESP48681 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NESP48681 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms