Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CHRNA7P36544 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms