Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms