Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTN2P35609 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms